آسیکلوویر برای درمان علائم آبله مرغان ، زونا ، عفونت های ویروسی زگیل تناسلی (در اندام های جنسی) ، پوست ، مغز و غشاهای مخاطی (لب و دهان) و عفونت های گسترده ویروس تبخال در نوزادان استفاده می شود. آسیکلوویر همچنین برای پیشگیری از عفونت های زگیل تناسلی مکرر استفاده می شود.