فیبریلاسیون دهلیزی فرد را در معرض خطر سکته مغزی قرار می دهد. با فیبریلاسیون دهلیزی ، انقباضات قلب سریعتر ، اما ضعیف تر از انقباضات معمولی قلب هستند و در نتیجه جریان خون در دهلیز کند می شود. تجمع خون ، می تواند منجر به تشکیل لخته خون شود . گاهی اوقات ، این لخته های خون از دهلیزها خارج شده ، از بطن ها عبور می کنند و در مغز ، ریه ها و سایر قسمت های بدن قرار می گیرند. اگر لخته خون از قلب خارج شود و به مغز برسد ، می تواند با مسدود کردن جریان خون در شریان های مغزی باعث سکته شود. در افراد بالای 80 سال ، فیبریلاسیون دهلیزی علت مستقیم 1 مورد از هر 4 مورد سکته مغزی است.
